Algo asi seria los pasos, te enumero los pasos a seguir:
1)Drenar el aceite del carter , mueve la palanca en todas sus posiciones para sacar el posible aceite atrapado en los laberintos de la transmision, no botes el aceite, examinalo que tanta agua hay.
2)Cambias el filtro.
3)Procede a llenar con aceite nuevo, pasa la llave sin encender el motor y mover la palanca para que el nuevo aceite penetre en los laberintos.
4)Desconectar una de las mangueras del radiador y preparar el recipiende de recoleccion.
5)Enciende el motor y observa el aceite que sale por la manguera, cuando veas que cambie la coloracion a rojo brillante es el aceite nuevo que sale, apaga el motor, en este paso es bueno contar con otra persona para que te ayude.
6)Reconecta la manguera al radiador, enciende el motor de nuevo y espera como 5min, mueve la palanca en todas sus posicines y procede a medir el nivel de aceite, debe estar en la marcas baja de COLD, si falta completale, deja por 10min mas y luego vuelves a medir en nivel.
Hasta aqui los pasos de un cambio de aceite para la transmision, ahora viene la parte de inspeccion, revisa si en la ultima medida de aceite hay presente burbujas, gotas de agua u otra anormalidad, ahora con el aceite que se saco pasalo por un colador a ver si no hay particulas de metales u otras, lo importante aparte de sacar el agua del sistema, es que no hayan daños por efecto del agua, si no hay residuos solidos, prueba rodar el vehiculo con suavidad como darle la vuelta a la manzana. Cualquier anomalia apaga el motor. Si todo sale bien yo en lo personale le haria otro cambio de aceite solamente a la semana, para eliminar cualquier vestigio de humedad. Disculpen lo extendido de la respuesta, comentanos como te fue. Suerte.