È molto semplice, se hai ad esempio il cilindro numero 1 al PMS e nel tuo motore, come dici, sono rimasti l'1 e il 4, ti rendi conto di quale dei due è in compressione guardando l'albero a camme. Affinché l'1 sia in compressione, devi mettere il cilindro 4 in "crossover", cioè quando una delle valvole finisce di chiudersi e l'altra inizia ad aprirsi. Cioè, il bilanciere esercita pressione sul 2, ed è allora che l'1 è in compressione. Il modo più semplice, se il tuo motore è a benzina, è togliere la candela e infilare il dito nel foro, girare il motore con un attrezzo e quando senti che il pistone spinge il dito a causa della compressione, allora è in fase di compressione. Spero di essermi spiegato.