El problema que tienes viene dado porque no hay comunicación entre el botón que acciona el compresor del A.A y la centralita de inyección del motor.
Esto se nota fácilmente en que cuando pones el aire acondicionado el motor se acelera un poco. En los motores de carburación de gasolina, existe un pulmón accionado por una electroválvula y el vacío del motor que tira del cable del acelerador para que el motor suba de régimen y no se cale.
La centralita de inyección aporta una cantidad de combustible "extra" cuando el aire acondicionado está encendido para evitar que el motor se cale fácilmente, además, en los cortes en deceleración, el suministro de gasolina se reestablece a partir de 1500 RPM en lugar de las 1000 RPM normales.
El fallo debe estar en el propio botón, en el cableado o en algún relé, si puedes llévalo a algún electricista que te lo mire.
Espero haberte ayudado.