la alarma no le corta la señal a la bobina, le corta la alimentación de positivo normalmente.
Puedes comprobar si a la bobina le llega corriente, conectando una bombilla pequeña de unos 5W en paralelo a la bobina, y a continuación dándole al arranque, la bombilla debe parpadear a medida que el motor voltea.
Si la bombilla no parpadea, te va a tocar comprobar la continuidad del cable de masa a la centralita, para ello, tendrás que desconectar la batería y con un polímetro comprobar cada uno de los terminales del enchufe de la centralita hasta que dés con el cable de la bobina. Pero no es una avería frecuente.
Otra cosa que te puede haber pasado y que es bastante más probable es que se halla quemado la propia bobina de encendido. Para ello no tienes nada más que comprobar la resistencia eléctrica de los arrollamientos primario y secundario, si la bobina está en corto o está interrumpido el circuito, no te va a dar chispa en alta.
Un saludo.